畜禽糞便發酵設備是通過通風、充氧、攪拌等作用控制溫度在５５～６０℃之間，達到糞污（或污泥）發酵處理的合適溫度，在此溫度時，能夠消滅糞污（或污泥）堆體中的大量病原菌和寄生蟲，同時利用除臭系統對排放的氣體進行生物臭味，達到糞污（或污泥）無害化處理的目的。

　　有機肥發酵罐結構上一般由遠程自動控制系統、液壓站、送風系統、生物除臭裝置組成。設備根據畜禽糞便發酵及生物菌激活條件要求，設備具備混料混氧攪拌、充分加溫物料溫度、除去物料濕度、對物料充氧的功能，同時根據物料循動要求，設備隨時間跟自身重力使物料向底部逐層下落。為完成以上做功要求，利用攪拌軸提供混料混氧攪拌，利用送風加熱系統對物料充氧并給物料加溫，利用熱風和發酵菌種產生的高溫綜合去濕，利用充氧風機對物料充氧。另外，進料直接通過入料口投入，出料時物料隨時間跟自身重力使物料向底部逐層下落，從出料口排出。

　　操作人員在外界通過調節原料的水分、氧氣含量和溫度，為好氧菌提供活性條件，使其進行高溫好氧發酵的技術，微觀上說就是利用微生物的活性進行有氧呼吸，將廢棄物中的有機質通過生物分解，從而達到無害化、穩定化、減量化、資源化利用的一體化畜禽廢棄物無害化處理設備。